Siden det første tilfellet av koronavirussykdom, i desember 2019, har pandemisk sykdom spredt seg til millioner av mennesker over hele verden.Denne globale pandemien i romanenalvorlig akutt respiratorisk syndrom coronavirus 2 (SARS-CoV-2)er en av de mest overbevisende og bekymringsfulle globale helsekrisene i moderne tid, og utgjør store trusler mot verden og påvirker alle aspekter av menneskelivet.[1]
Koronavirus er innkapslede, positiv sans, enkeltstrengede RNA-virus i Coronaviridae-familien, som har et bredt spekter av verter som mennesker, flaggermus, kameler og fuglearter, inkludert husdyr og selskapsdyr, og utgjør en trussel mot folkehelsen. 1 Koronavirus er klassifisert i underfamilien til Orthocoronavirinae, som er videre delt inn i fire slekter, basert på forskjeller i proteinsekvenser: a-coronavirus, b-coronavirus, g-coronavirus og d-coronavirus.A-coronavirusene og b-coronavirusene infiserer bare pattedyr, mens g-coronavirusene og d-coronavirusene først og fremst infiserer fugler, selv om noen av dem kan infisere pattedyr.HCoV-229E,
oV-OC43, HCoV-NL63, HCoV-HKU1, SARSCoV, MERS-CoV og SARS-CoV-2 er de syv koronavirusene som er identifisert for å infisere mennesker.Blant dem er SARSCoV og MERS-CoV, som har dukket opp i den menneskelige befolkningen i 2002 og 2012, svært patogene.Mens stammer av humant koronavirus (HCoV)-229E, HCoV-NL63, HCoV-OC43 eller HCoV-HKU1 som sirkulerer i den menneskelige befolkningen, forårsaker bare forkjølelse,7 alvorlig akutt respiratorisk syndrom coronavirus 2 (SARS-CoV2), årsak til COVID-19, er et nytt b-coronavirus, som dukket opp tidlig på slutten av 2019 og har resultert i ødeleggende dødsfall.De primære symptomene påCOVID-19ligner på SARS-CoV og MERS-CoV: feber, tretthet, tørr hoste, øvre brystsmerter, noen ganger diaré og dyspné.I motsetning til tidligerekoronavirus (CoV) infeksjoner, den raske globale spredningen, høye overføringshastigheten, lengre inkubasjonstid, mer asymptomatiske infeksjoner og sykdomsgraden av SARS-CoV-2 krever inngående kunnskap om virusunnvikelsesstrategier.
I likhet med andre humane koronavirus (SARS-CoV-2, MERS-CoV), har SARSCoV-2 også et enkeltstrenget RNA-genom med positiv sans på rundt 30 kb i størrelse.Som vist i figur 1, binder de virale nukleokapsid (N) proteinene genomet til et stort ribonukleoprotein (RNP) kompleks, som deretter omsluttes av lipider og virale proteiner S (spike), M (membran) og E (konvolutt).Den 50 enden av genomet har to store åpne leserammer (ORF-er), ORF1a og ORF1b, som koder for polypeptider pp1a og pp1b, som produseres til 16 ikke-strukturelle proteiner (NSP-er) som involverer alle aspekter av viral replikasjon av virale proteaser NSP3 og NSP5 som inneholder henholdsvis et papainlignende proteasedomene og et 3C-lignende proteasedomene.9 Den 30 enden av genomet koder for strukturelle proteiner og tilleggsproteinene, hvorav ORF3a, ORF6, ORF7a og ORF7b har vist seg å være virale strukturelle proteiner involvert. i dannelsen av virale partikler og ORF3b og ORF6 fungerer som interferonantagonister.I henhold til gjeldende merknad på grunnlag av sekvenslikhet med andre b-coronavirus, inkluderer SARS-CoV-2 spådommer om seks tilbehørsproteiner (3a, 6, 7a, 7b, 8 og 10).Imidlertid er ikke alle disse ORF-ene eksperimentelt validert ennå, og det nøyaktige antallet tilleggsgener til SARS-CoV-2 er fortsatt et stridspunkt.Derfor er det fortsatt uklart hvilke tilleggsgener som faktisk uttrykkes av dette kompakte genomet.[2]
Svært sensitive og spesifikke tester er avgjørende for å identifisere og håndtere COVID-19-pasienter, samt å implementere kontrolltiltak for å begrense utbruddet.Point-of-care (POC) molekylære tester har potensial til å tillate tidligere påvisning og 2 isolering av bekreftede SARS-CoV-2 tilfeller, sammenlignet med laboratoriebaserte diagnostiske metoder, og dermed redusere overføring i husholdninger og lokalsamfunn.
[1]Klinisk og operasjonell påvirkning av rask påvisning av SARS-CoV-2 på en akuttavdeling
[2] Kampen mellom verten og SARS-CoV-2: Medfødt immunitet og virale unnvikelsesstrategier
Innleggstid: 25. mai 2022